안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 설태(tongue coating)에 대해 간략하게 살펴보고자 합니다. 백설이라고도 알려진 설태는 혀에 흰색 코팅이 나타나는 증상입니다. 이는 일반적으로 박테리아, 음식물 및 기타 죽은 세포가 혀의 papillae 사이에 축적될 때 발생합니다. papillae는 혀의 독특한 질감을 제공하는 혀 표면의 특징입니다. 혀 등의 papillae 구조는 구강 찌꺼기 및 미생물이 축적되기 쉬운 넓은 표면적을 제공하는 독특한 생태학적 구강 부위를 형성합니다. 미생물군집은 병원체로부터 우리를 보호하고, 면역 체계의 발달에 기여하며, 다양한 화합물의 대사를 돕습니다. 한편 설태는 다양한 질병과 연관될 수 있습니다. 예를 들어, 혀를 덮고 있는 미생물군의 변화는 위염과 소화기 계통의 ..

# 마이크로바이옴 분류의 중요한 도구, 16S ribosomal RNA (16S rRNA) 마이크로바이옴의 맥락에서 16S 리보솜 RNA(rRNA)는 박테리아와 고세균의 세포에서 발견되는 유전 물질의 한 유형이다. 16S rRNA는 특히 미생물의 분류 및 식별뿐만 아니라 미생물 군집의 다양성과 구성을 이해하는 데 중요한 역할을 한다. 16S rRNA 유전자는 16S rRNA 분자를 암호화하는 DNA 부분으로 고도로 보존되어 모든 박테리아와 고세균에 존재하지만 다른 종 사이에서 서열이 다르다. 이 서열 변이를 통해 16S rRNA 유전자 서열을 기반으로 미생물을 구별하고 분류할 수 있다. 예를 들면, 마이크로바이옴을 연구하기 위해 종종 장, 피부 또는 환경에서 얻은 것과 같은 미생물 샘플에서 DNA를 추출..

# 운영 분류 단위가 뭐야? 미생물 연구에서 OTU(운영 분류 단위)는 서열 유사성에 따라 정의되는 미생물 군집이다. OTU는 일반적으로 DNA 서열의 유사성을 기반으로 박테리아 및 기타 미생물을 개별 분류 단위로 그룹화하는 방법으로 사용된다. OTU를 생성하기 위해 일반적으로 미생물 샘플에서 16S rRNA 유전자와 같은 박테리아 게놈의 특정 유전자 또는 영역을 시퀀싱한다. 다음으로 샘플에 있는 서로 다른 미생물의 DNA 서열을 비교하고 동일한 OTU로 유사한 서열을 그룹화한다. OTU를 정의하는 데 사용되는 서열 유사성 수준은 연구에 따라 다를 수 있지만 공통 임계값은 97% 유사성이다. 이는 적어도 97% 동일한 두 시퀀스가 동일한 OTU로 그룹화됨을 의미한다. OTU는 다양한 샘플에서 미생물을 비..

[과학체험] 현미경 체험 캠프 현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링 nv2ngn.tistory.com 오늘은 마이크로바이옴과 관련한 샤논 지수에 대해 알아 보자 # 샤논 지수가 뭐야? 샤논 지수(Shannon index)는 군집 내에서 종의 다양성을 정량화하는 데 사용되는 알파 다양성의 척도이다. 마이크로바이옴 연구에서 Shannon 지수는 종종 샘플에 존재하는 미생물의 다양성을 평가하는 데 사용된다. 샤논 지수를 계산하기 위해 샘플에 있는 각 종의 상대적 풍부도를 결정한 다음 다음 공식을 사용하여 지수를 계산한다. H = -Σ(p_i * ln(p_i)) 여기..

# Metagenomics, metatranscriptomics 및 metabolomics가 뭐야? Metagenomics, Metatranscriptomics 및 Metabolomics는 장, 토양, 해양 또는 기타 환경에서 발견되는 것과 같은 복잡한 미생물 군집의 유전 및 대사 구성을 분석하는 데 중점을 둔 연구 분야다. Metagenomics: 일반적으로 DNA 또는 RNA 서열을 분석하여 전체 미생물 군집의 유전 물질에 대한 연구다. 이 접근 방식을 통해 실험실에서 쉽게 배양할 수 없는 미생물을 포함하여 커뮤니티 내 미생물의 다양성과 기능적 잠재력을 식별하고 연구할 수 있다. Metatranscriptomics: metagenomics와 유사하지만 DNA나 RNA 염기서열을 분석하는 대신 미생물 ..

# 주의 본 내용은 언론 및 인터넷 공개된 내용을 기반한 지극히 초심자인 개인의 주관적 관점이다. 오해 없기 바란다. 특정 기업을 홍보하거나 비하할 목적이 아님을 미리 밝히는 바이다. 또한 이 기업에 대한 투자 결정에 책임이 없음을 인지하기 바란다. 투자의 책임은 투자자 자신이다 # Caution This content is the subjective point of view of an individual who is an extremely beginner based on information disclosed in the media and on the Internet. I hope there is no misunderstanding. I would like to state in advance that ..