[궁금사전] 운영 분류 단위 (operational taxonomic unit)
2023. 4. 13. 23:01ㆍ카테고리 없음
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# 운영 분류 단위가 뭐야?
미생물 연구에서 OTU(운영 분류 단위)는 서열 유사성에 따라 정의되는 미생물 군집이다.
OTU는 일반적으로 DNA 서열의 유사성을 기반으로
박테리아 및 기타 미생물을 개별 분류 단위로 그룹화하는 방법으로 사용된다.
OTU를 생성하기 위해 일반적으로 미생물 샘플에서
16S rRNA 유전자와 같은 박테리아 게놈의 특정 유전자 또는 영역을 시퀀싱한다.
다음으로 샘플에 있는 서로 다른 미생물의 DNA 서열을 비교하고 동일한 OTU로 유사한 서열을 그룹화한다.
OTU를 정의하는 데 사용되는 서열 유사성 수준은 연구에 따라 다를 수 있지만 공통 임계값은 97% 유사성이다.
이는 적어도 97% 동일한 두 시퀀스가 동일한 OTU로 그룹화됨을 의미한다.
OTU는 다양한 샘플에서 미생물을 비교하고 그룹화하는 방법을 제공하므로
미생물의 다양성 및 커뮤니티 구성을 연구하는 데 유용하다.
그러나 OTU는 종이나 속과 같은 분류학적 단위와 동일하지 않다는 점에 유의해야 한다.
오히려 OTU는 DNA 서열 유사성을 기반으로 미생물을 군집화하는 방법이며 여러 분류군을 포함할 수 있다.
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