alpha diversity(3)
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[궁금사전] 설태와 관련 질환 및 마이크로바이옴
안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 설태(tongue coating)에 대해 간략하게 살펴보고자 합니다. 백설이라고도 알려진 설태는 혀에 흰색 코팅이 나타나는 증상입니다. 이는 일반적으로 박테리아, 음식물 및 기타 죽은 세포가 혀의 papillae 사이에 축적될 때 발생합니다. papillae는 혀의 독특한 질감을 제공하는 혀 표면의 특징입니다. 혀 등의 papillae 구조는 구강 찌꺼기 및 미생물이 축적되기 쉬운 넓은 표면적을 제공하는 독특한 생태학적 구강 부위를 형성합니다. 미생물군집은 병원체로부터 우리를 보호하고, 면역 체계의 발달에 기여하며, 다양한 화합물의 대사를 돕습니다. 한편 설태는 다양한 질병과 연관될 수 있습니다. 예를 들어, 혀를 덮고 있는 미생물군의 변화는 위염과 소화기 계통의 ..
2023.12.06 -
[궁금사전] 샤논 지수 (Shannon Index)와 알파 다양성 (alpha diversity)의 척도
[과학체험] 현미경 체험 캠프 현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링 nv2ngn.tistory.com 오늘은 마이크로바이옴과 관련한 샤논 지수에 대해 알아 보자 # 샤논 지수가 뭐야? 샤논 지수(Shannon index)는 군집 내에서 종의 다양성을 정량화하는 데 사용되는 알파 다양성의 척도이다. 마이크로바이옴 연구에서 Shannon 지수는 종종 샘플에 존재하는 미생물의 다양성을 평가하는 데 사용된다. 샤논 지수를 계산하기 위해 샘플에 있는 각 종의 상대적 풍부도를 결정한 다음 다음 공식을 사용하여 지수를 계산한다. H = -Σ(p_i * ln(p_i)) 여기..
2023.04.13 -
[궁금사전] 알파 다양성(Alpha Diversity)과 베타 다양성(Beta Diversity) 그리고 감마 다양성(Gamma Diversity)
[과학체험] 현미경 체험 캠프 현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링 nv2ngn.tistory.com 알파, 베타 및 감마 다양성은 특정 생태계에서 미생물 다양성의 다른 측면을 설명하는 용어다. 마이크로바이옴은 인간의 위장관이나 토양과 같은 특정 환경에 서식하는 미생물의 집합체다. 다음은 각 다양성 측정 방법이 마이크로바이옴과 어떻게 관련되는지에 대한 설명이다. # 알파 다양성 (Alpha Diversity) 알파 다양성은 미생물 군집 내에서의 다양성을 나타내는 개념이다. 즉, 미생물 군집 내에 다양한 종이 존재하고, 분포가 균등하게 되어 있으면, 알파 다양성..
2023.03.23