2023. 5. 15. 21:57ㆍ카테고리 없음
# 마이크로바이옴 분류의 중요한 도구, 16S ribosomal RNA (16S rRNA)
마이크로바이옴의 맥락에서 16S 리보솜 RNA(rRNA)는 박테리아와 고세균의 세포에서 발견되는 유전 물질의 한 유형이다.
16S rRNA는 특히 미생물의 분류 및 식별뿐만 아니라 미생물 군집의 다양성과 구성을 이해하는 데 중요한 역할을 한다.
16S rRNA 유전자는 16S rRNA 분자를 암호화하는 DNA 부분으로 고도로 보존되어
모든 박테리아와 고세균에 존재하지만 다른 종 사이에서 서열이 다르다.
이 서열 변이를 통해 16S rRNA 유전자 서열을 기반으로 미생물을 구별하고 분류할 수 있다.
예를 들면, 마이크로바이옴을 연구하기 위해 종종 장, 피부 또는 환경에서 얻은 것과 같은 미생물 샘플에서
DNA를 추출한다. 추출된 DNA에서 16S rRNA 유전자를 증폭하고 시퀀싱한다.
결과 서열의 데이터를 분석하여 샘플에 존재하는 박테리아 또는 고세균의 유형을 식별하고 그 양을 추정할 수 있다.
16S rRNA 유전자는 고도로 보존된 영역(프라이머 설계 및 증폭에 사용)과
가변 영역(종 식별 및 분류에 사용)을 모두 포함하기 때문에 미생물 군집 분석에 사용되는 것이다.
16S rRNA 유전자 서열의 가변 영역을 기존 데이터베이스와 비교함으로써
미생물을 알려진 분류 그룹에 할당하거나 새로운 그룹을 발견할 수도 있다.
16S rRNA 유전자 시퀀싱 또는 앰플리콘 시퀀싱으로 알려진 이 접근법은 마이크로바이옴에 대한 이해를 확장시킨다.
이를 통해 개별 미생물을 배양할 필요 없이 미생물 군집을 특성화할 수 있기 때문이다.
어떤 경우에는 많은 종에서 종종 미생물을 배양하기 어렵거나 불가능하다.
16S rRNA 유전자 서열을 연구함으로써 다양한 건강 상태, 질병 또는 환경 요인과 관련된
미생물 군집의 다양성, 상대적 존재비 및 변화를 평가할 수 있다.
요약하면, 16S 리보솜 RNA는 미생물군집 연구에서 중요한 도구로,
미생물 군집의 다양성과 구성에 대한 통찰력을 제공하고 박테리아와 고세균의 식별 및 분류를 돕는다고 할 것이다.