안녕하세요!NV2NGN입니다. 이번 글에서는 인체 대변과 연동운동을 적용한 장-온-칩 (Gut-on-a-chip): 흑색종 면역관문억제제 반응 예측에 관한 연구 결과를 살펴보고자 합니다. 최근 암 치료에서 가장 주목받는 방법 중 하나는 면역관문억제제(Immune Checkpoint Inhibitor, ICI)입니다. 특히 흑색종과 같은 난치성 암에서 이 치료법은 일부 환자에게 놀라운 효과를 보이지만, 모든 환자가 똑같이 반응하는 것은 아닙니다. 왜 어떤 환자는 효과를 보고, 어떤 환자는 그렇지 않을까요? 그 해답을 찾기 위해 과학자들은 우리 몸속의 '장내 미생물'에 주목하고 있습니다. 장내 미생물은 우리가 먹는 음식, 면역 반응, 심지어 약물의 효과까지 다양한 생리 현상에 영향을 미칩니다.하지만 인간과 ..

안녕하세요!NV2NGN입니다. 오늘은 장내 미생물의 대사산물이 수면 부족으로 인해 생기는 기억력 저하를 막아준다는 흥미로운 연구를 훑어 보겠습니다. 수면 부족이 우리의 뇌와 기억력에 얼마나 해로운지는 이미 잘 알려져 있습니다. 밤을 새우거나 잠을 충분히 자지 못하면 집중력이 떨어지고, 기억력이 감퇴하며, 기분도 나빠집니다. 그런데 최근 연구들은 이런 인지 저하 현상에 ‘장내 미생물’과 그들이 만들어내는 대사산물이 중요한 역할을 한다는 사실에 주목하고 있습니다. 이번 연구에서는 특히 ‘인돌-3-아세트산(IAA)’이라는 장내 미생물 대사산물에 주목했습니다. IAA는 장내 세균이 만들어내는 물질로, 식물 호르몬으로도 잘 알려져 있지만, 동물의 장과 뇌 건강에도 영향을 미칠 수 있습니다. 연구진은 수면 부족(실..

안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 메타트랜스크립토믹스 (metatranscriptomics)에 대해 살펴보고자 합니다.   메타트랜스크립토믹스 (metatranscriptomics)란?  메타트랜스크립토믹스는 환경 시료에 존재하는 복잡한 미생물 군집의 조절 및 발현 프로필에 대한 정보를 제공하는 metagenomic mRNA(metatranscriptome)의 추출 및 분석에 대한 연구를 다룹니다.  메타트랜스크립토믹스와 16S rRNA시퀀싱과의 차이 16S rRNA 시퀀싱은 주로 세균과 고세균의 계통학적 분류와 식별에 사용됩니다. 이 방법은 특정 세균의 존재 여부를 확인하는 데 매우 유용하지만, 각 균의 유전자 발현 패턴을 직접적으로 유추하거나 특정 유전자가 발현될지 추정하는 데는 한계가 있습니다..

안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 dDDH라는 용어에 대해 살펴 보겠습니다. 디지털 DNA-DNA 혼성화( Digital DNA-DNA hybridization, dDDH)는 서로 다른 두 박테리아 종이 얼마나 밀접하게 관련되어 있는지 확인하기 위해 미생물학에서 사용되는 현대 기술입니다. 쉬운 예를 들어 보겠습니다. 여기 두 종류의 박테리아의 DNA를 나타내는 서로 다른 두 세트의 LEGO 블록이 있다고 상상해 보세요. dDDH는 이 두 세트가 얼마나 잘 상호 교환되거나 서로 들어맞을 수 있는지를 측정합니다. dDDH 값이 높을수록 두 박테리아가 더 밀접하게 관련되어 있음을 의미합니다. 이 방법은 컴퓨터 알고리즘을 사용하여 DNA 서열을 비교하므로 디지털 방식입니다. 이는 가계도의 첨단 기술 버전과..

[과학체험] 현미경 체험 캠프 현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링 nv2ngn.tistory.com # 뉴젠트 점수 (Nugent scores)란? 뉴젠트 기준 또는 뉴젠트 점수 시스템이라고도 하는 뉴젠트 점수는 대개 질 감염인 세균성 질염(bacterial vaginosis, BV)을 진단하고 평가하는 데 사용하는 방법이다. 뉴젠트 점수 시스템은 질 도말의 현미경 검사를 바탕으로 질 마이크로바이옴 (vaginal microbiome)에 존재하는 박테리아의 유형과 양을 평가하는 것이다. BV는 정상적인 락토바실러스(Lactobacillus) 박테리아가 감소하..

[과학체험] 현미경 체험 캠프현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링nv2ngn.tistory.com 알파, 베타 및 감마 다양성은 특정 생태계에서 미생물 다양성의 다른 측면을 설명하는 용어다. 마이크로바이옴은 인간의 위장관이나 토양과 같은 특정 환경에 서식하는 미생물의 집합체다. 다음은 각 다양성 측정 방법이 마이크로바이옴과 어떻게 관련되는지에 대한 설명이다. # 알파 다양성 (Alpha Diversity) 알파 다양성은 미생물 군집 내에서의 다양성을 나타내는 개념이다.즉, 미생물 군집 내에 다양한 종이 존재하고, 분포가 균등하게 되어 있으면, 알파 다양성 ..