microbiome(5)
-
[궁금사전] 메타트랜스크립토믹스 (metatranscriptomics)와 16S rRNA 시퀀싱
안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 메타트랜스크립토믹스 (metatranscriptomics)에 대해 살펴보고자 합니다. 메타트랜스크립토믹스 (metatranscriptomics)란? 메타트랜스크립토믹스는 환경 시료에 존재하는 복잡한 미생물 군집의 조절 및 발현 프로필에 대한 정보를 제공하는 metagenomic mRNA(metatranscriptome)의 추출 및 분석에 대한 연구를 다룹니다. 메타트랜스크립토믹스와 16S rRNA시퀀싱과의 차이 16S rRNA 시퀀싱은 주로 세균과 고세균의 계통학적 분류와 식별에 사용됩니다. 이 방법은 특정 세균의 존재 여부를 확인하는 데 매우 유용하지만, 각 균의 유전자 발현 패턴을 직접적으로 유추하거나 특정 유전자가 발현될지 추정하는 데는 한계가 있습니다..
2024.07.29 -
[궁금사전] 디지털 DNA-DNA 혼성화 (Digital DNA-DNA hybridization, dDDH)
안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 dDDH라는 용어에 대해 살펴 보겠습니다. 디지털 DNA-DNA 혼성화( Digital DNA-DNA hybridization, dDDH)는 서로 다른 두 박테리아 종이 얼마나 밀접하게 관련되어 있는지 확인하기 위해 미생물학에서 사용되는 현대 기술입니다. 쉬운 예를 들어 보겠습니다. 여기 두 종류의 박테리아의 DNA를 나타내는 서로 다른 두 세트의 LEGO 블록이 있다고 상상해 보세요. dDDH는 이 두 세트가 얼마나 잘 상호 교환되거나 서로 들어맞을 수 있는지를 측정합니다. dDDH 값이 높을수록 두 박테리아가 더 밀접하게 관련되어 있음을 의미합니다. 이 방법은 컴퓨터 알고리즘을 사용하여 DNA 서열을 비교하므로 디지털 방식입니다. 이는 가계도의 첨단 기술 버전과..
2023.11.17 -
[궁금사전] 뉴젠트 점수 (Nugent scores)와 세균성 질염 (bacterial vaginosis, BV)
[과학체험] 현미경 체험 캠프 현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링 nv2ngn.tistory.com # 뉴젠트 점수 (Nugent scores)란? 뉴젠트 기준 또는 뉴젠트 점수 시스템이라고도 하는 뉴젠트 점수는 대개 질 감염인 세균성 질염(bacterial vaginosis, BV)을 진단하고 평가하는 데 사용하는 방법이다. 뉴젠트 점수 시스템은 질 도말의 현미경 검사를 바탕으로 질 마이크로바이옴 (vaginal microbiome)에 존재하는 박테리아의 유형과 양을 평가하는 것이다. BV는 정상적인 락토바실러스(Lactobacillus) 박테리아가 감소하..
2023.06.09 -
[궁금사전] 알파 다양성(Alpha Diversity)과 베타 다양성(Beta Diversity) 그리고 감마 다양성(Gamma Diversity)
[과학체험] 현미경 체험 캠프 현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링 nv2ngn.tistory.com 알파, 베타 및 감마 다양성은 특정 생태계에서 미생물 다양성의 다른 측면을 설명하는 용어다. 마이크로바이옴은 인간의 위장관이나 토양과 같은 특정 환경에 서식하는 미생물의 집합체다. 다음은 각 다양성 측정 방법이 마이크로바이옴과 어떻게 관련되는지에 대한 설명이다. # 알파 다양성 (Alpha Diversity) 알파 다양성은 미생물 군집 내에서의 다양성을 나타내는 개념이다. 즉, 미생물 군집 내에 다양한 종이 존재하고, 분포가 균등하게 되어 있으면, 알파 다양성..
2023.03.23 -
[바이오기업] 마이크로바이옴 기반 기업 (주)고바이오랩 국내 특허 동향
# 주의 본 내용은 언론 및 인터넷 공개된 내용을 기반한 지극히 초심자인 개인의 주관적 관점이다. 오해 없기 바란다. 특정 기업을 홍보하거나 비하할 목적이 아님을 미리 밝히는 바이다. 또한 이 기업에 대한 투자 결정에 책임이 없음을 인지하기 바란다. 투자의 책임은 투자자 자신이다 # Caution This content is the subjective point of view of an individual who is an extremely beginner based on information disclosed in the media and on the Internet. I hope there is no misunderstanding. I would like to state in advance that ..
2023.03.09