안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 5xFAD 마우스 모델에 대해 알아보고자 합니다. 5xFAD 마우스 모델(034840-JAX)은 가족성 알츠하이머병(AD) 연구에 널리 사용되는 모델입니다. 다음과 같은 몇 가지 주요 특징을 보입니다. 1. 도입유전자(transgene): 5xFAD 마우스는 총 5개의 AD 관련 돌연변이(APP와 PSEN1 유전자를 발현합니다: 스웨덴(K670N/M671L), 플로리다(I716V) 및 런던(V717I) 돌연변이)가 있는 인간 APP 및 PSEN1의 M146L 및 L286V 돌연변이. 2. 아밀로이드 병리학: 이 마우스는 초기 베타-아밀로이드(Aβ) 침착을 포함하여 알츠하이머병 아밀로이드 병리학의 주요 특징을 나타냅니다. 이는 신경내 Aβ-42로 인한 신경퇴행 및 아..

안녕하세요? NV2NGN입니다. 이번 시간에는 차세대 시퀀싱(next-generation sequencing, NGS) 에서 종종 나타나는 위양성(False positives, 거짓 양성 즉 음성인데 양성으로 나타남)에 대해 생각해 보겠습니다. NGS는 높은 처리량과 속도로 인해 게놈 연구에 혁명을 일으켰습니다. 그러나 어려움이 없는 것은 아닙니다. NGS의 중요한 문제 중 하나는 유전자 변이에 대한 잘못된 호출인 거짓 양성의 발생입니다. 왜 이런 현상이 나타날까요? NGS의 거짓 양성은 시퀀싱 오류, 정렬 오류, 생물정보 처리 등 다양한 단계에서 발생할 수 있습니다. 예를 들면, 라이브러리 준비 또는 시퀀싱 프로세스 중에 시퀀싱 오류가 발생할 수 있습니다. 또한 리드(reads)가 참조 게놈에 잘못 매..

안녕하세요? NV2NGN입니다. 최근 chatgpt의 급부상으로 프롬프트 디자이너(prompt designer)의 역할과 중요성에 대해 관심을 가지고 있습니다. 프롬프트 디자이너는 생성형 AI를 효과적으로 활용하기 위해 지시어를 제공하는 전문가입니다. 이들은 AI가 원하는 결과를 생성하도록 가이드하며, 이는 비즈니스, 교육, 연구 등 다양한 분야에서 중요한 역할을 합니다. AI 활용 프롬프트 디자이너 (AIPD) 2급 시험은 한국지식재산서비스협회가 주관하는 시험으로, 생성형 AI를 활용하는 전문가를 검증하는 목적으로 마련되었습니다. 이 시험은 생성형 AI 관련 전문기업, 일반기업체, 대학, 공공기관, 연구소 등 생성형 AI 활용 업무 종사 (예정)자 및 관심자에게 열려 있습니다. 이 시험을 통해 챗GPT..

안녕하세요? NV2NGN입니다. 이번 글에서는 평균 뉴클레오티드 동일성 (Average Nucleotide Identity , ANI)에 대해 알아 보겠습니다. 지난 글에서 설명했던 dDDH 개념을 기억하시나요? [궁금사전] 디지털 DNA-DNA 혼성화 (Digital DNA-DNA hybridization, dDDH) 안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 dDDH라는 용어에 대해 살펴 보겠습니다. 디지털 DNA-DNA 혼성화( Digital DNA-DNA hybridization, dDDH)는 서로 다른 두 박테리아 종이 얼마나 밀접하게 관련되어 있는지 확인 nv2ngn.tistory.com 미생물학에서 디지털 DNA-DNA 혼성화(dDDH) 값은 두 박테리아 종이 유전적 수준에서 얼마나 유사한지를 ..

안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 dDDH라는 용어에 대해 살펴 보겠습니다. 디지털 DNA-DNA 혼성화( Digital DNA-DNA hybridization, dDDH)는 서로 다른 두 박테리아 종이 얼마나 밀접하게 관련되어 있는지 확인하기 위해 미생물학에서 사용되는 현대 기술입니다. 쉬운 예를 들어 보겠습니다. 여기 두 종류의 박테리아의 DNA를 나타내는 서로 다른 두 세트의 LEGO 블록이 있다고 상상해 보세요. dDDH는 이 두 세트가 얼마나 잘 상호 교환되거나 서로 들어맞을 수 있는지를 측정합니다. dDDH 값이 높을수록 두 박테리아가 더 밀접하게 관련되어 있음을 의미합니다. 이 방법은 컴퓨터 알고리즘을 사용하여 DNA 서열을 비교하므로 디지털 방식입니다. 이는 가계도의 첨단 기술 버전과..

안녕하세요? NV2NGN입니다. 오늘은 DNA가 RNA로 전사(transcription)되는 과정에 대해 생각해 보고자 합니다. 전사 과정에서 이 DNA 서열은 상보적인 RNA 가닥을 합성하기 위한 주형으로 사용됩니다. 만약 DNA 서열이 "GCGACGATTT"라고 한다면, 여기서 DNA 서열의 각 'T'는 RNA 서열의 'U'로 대체됩니다. 이 RNA 서열은 번역 과정에서 단백질 합성에 사용될 수 있습니다. 이는 유전자 발현을 가능하게 하는 분자 생물학의 기본 과정입니다. 특히, 분자 생물학에서 DNA를 RNA로 전환하는 중요성을 몇 가지 살펴 봅니다. 1. 단백질 합성 : 전사는 단백질 합성의 첫 번째 단계입니다. 이는 단백질 합성의 주형 역할을 하는 mRNA를 생성합니다. 2. 유전자 조절: 전사 ..