나노포어시퀀싱(2)
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[논문 맛보기] 후성적 종양 이질성 (Epigenetic heterogeneity in tumor)
# 나노포어 시퀀싱으로 종양의 후성적 이질성을 확인할 수 있을까 그동안 나노포어 시퀀싱은 시퀀싱 과학의 차세대 기술로 발전했다. 특히 기공의 효율성, DNA 전위를 제어하는 메커니즘, 신호 대 잡음비 향상, 긴 판독 (long read) 범위로 확장시키고자 하는 연구를 통해 이루어졌다. 후성유전학에 관한 이질성은 후성유전체의 돌연변이가 광범위할 것이기에 암 연구에서 새로운 도전이 될 것이다. DNA 메틸화와 히스톤 변형을 촉매하는 후성유전적 효소는 암세포에서 조절이 잘 되지 않아 수많은 이질적인 클론이 진화하게 된다. 이 클론에서 이질성을 탐지하는 것은 다양한 암 유형의 치료에 없어서는 안 될 역할을 할 것이다. 단일 세포 프로파일링을 통해 나노포어 시퀀싱 기술은 긴 판독에서 간단한 시퀀스를 확보할 수 ..
2022.09.09 -
[논문 맛보기] 외상후 스트레스 장애 PTSD 발현 분석
# 나노포어 시퀀싱 기술로 PTSD 과정에서 성별 특이적인 전사체와 에피전사체의 특징들을 발견하다 이 논문은 오스트레일리아 시드니대 뇌 정신 센터 Anand Gururajan 연구진의 연구 결과이다. 최근 시퀀싱 기술의 발달로 외상 후 스트레스 장애(posttraumatic stress disorder, PTSD)를 분자 병리학적인 차원에서 이해하는 것이 가능해지고 있으며, 특히 옥스포드 사의 나노포어 다이렉트 RNA-seq (Oxford Nanopore direct RNA-seq, dsRNA-seq)으로 에피전사체(epittranscriptome) 으로 통칭되는 다양한 RNA 변형을 조사하는 것이 가능해졌다. 이 논문에서는 Pavlovian cued-fear 조건으로 유도된 PTSD와 같은 ..
2022.09.07