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[ONT-나노포어 시퀀싱] 췌장 베타 세포주에서 포도당에 반응하는 RNA 변형 분석법(bioRxiv [Preprint]. 2025 Jun 12)
안녕하세요?NV2NGN입니다. 이번 글에서는 direct RNA 나노포어 시퀀싱을 통해 인간 췌장 베타세포에서 포도당 자극 후 빠르게 변화하는 RNA 변형을 규명한 연구를 간략히 살펴 보겠습니다. 우리 몸의 세포는 외부 자극에 따라 유전자 발현을 조절하며, 이 과정에서 RNA의 다양한 변형이 중요한 역할을 합니다.하지만 DNA의 화학적 변형(에피유전체, epigenome)에 비해 RNA 변형(에피트랜스크립톰, epitranscriptome)은 아직 많이 연구되지 않았습니다. 최근 연구에서는 RNA 변형이 유전자 발현과 세포 기능에 미치는 영향이 점점 더 주목받고 있습니다. 이번 연구에서는 인간 췌장 베타세포(EndoC-BH1, EndoC-BH3)를 대상으로, 포도당 자극 1시간 후 RNA 변형과 유전자..
2026.01.03 -
[ONT-나노포어 시퀀싱] 혈액 속 폐암 신호를 나노포어 기술로 RNA 메틸화까지 분석하는 새로운 진단법
안녕하세요?NV2NGN입니다. 이번 글에서는 혈액 속 폐암 신호를 나노포어 기술로 RNA 메틸화를 분석하는 연구 결과를 살펴보고자 합니다. 암을 조기에 진단하는 것은 환자의 생존율을 크게 높일 수 있는 중요한 과제입니다. 최근에는 ‘액체생검’이라는 방법이 각광받고 있습니다. 액체생검이란, 혈액 등 체액에서 암세포에서 유래한 DNA나 RNA 같은 ‘순환 핵산’을 찾아내 암을 진단하는 기술입니다. 기존에는 주로 DNA 염기서열(유전정보)만을 분석했지만, 최근에는 그 이상의 정보를 활용하려는 시도가 활발합니다. 예를 들어, DNA나 RNA에 붙는 화학적 표지(후생유전학적 정보), 조각의 크기(프래그먼토믹스), 기타 화학적 특성까지 분석해 진단의 정확도를 높이고 있습니다. 이 논문에서는 특히 RNA의 ‘화학적 ..
2026.01.03 -
[ONT-나노포어 시퀀싱] 나노포어 기술로 DNA 메틸화를 분석하여 나이와 체액 종류를 알아내는 법의학적 방법(Forensic Sci Int Genet. 2026 Feb)
안녕하세요!NV2NGN입니다. 이번 글에서는 나노포어 시퀀싱을 이용해 NA 메틸화를 분석하여 나이와 체액 종류를 알아내고자 한연구 결과를 살펴보고자 합니다. 범죄 현장에서 남겨진 작은 흔적, 예를 들어 머리카락 한 올이나 혈흔 한 방울이 범인을 잡는 결정적 단서가 될 수 있다는 사실, 영화나 드라마에서 자주 보셨을 겁니다. 실제로 현대 법의학에서는 DNA 분석이 범죄 수사에 매우 중요한 역할을 하고 있습니다. 그런데 DNA 분석은 단순히 '누구의 것인가'를 밝히는 데 그치지 않고, 그 사람의 나이, 외모, 심지어 어떤 체액(혈액, 타액 등)인지까지도 추정할 수 있는 수준으로 발전하고 있습니다. 이 논문은 바로 그 중에서도 'DNA 메틸화'라는 후생유전학적 정보를 이용해, 범죄 현장에서 얻은 미량의 DN..
2026.01.03 -
[ONT-나노포어 시퀀싱] 병원 조직검사 표본(FFPE)에서 나노포어 메틸화 분석으로 뇌종양을 분류하는 새로운 방법 (NAR Cancer. 2025 Oct 30)
안녕하세요!NV2NGN입니다.오랜만에 인사드립니다. 오늘은 나노포어 시퀀싱(nanopore sequencing)으로 조직검사 표본에서 메틸화 분석으로 뇌종양을 분류하고자 한 연구를 빠르게 훑어 보겠습니다. NAR Cancer. 2025 Oct 30;7(4):zcaf038. doi: 10.1093/narcan/zcaf038. eCollection 2025 Dec.Brain tumor classification from FFPE samples using nanopore methylation sequencing 뇌종양은 환자의 생명과 직결되는 심각한 질환입니다. 뇌종양의 종류와 특성을 정확하게 진단하는 것은 환자에게 가장 적합한 치료법을 선택하는 데 매우 중요합니다. 최근에는 환자마다 다른 유전자 정보를 바탕..
2026.01.03