[궁금계산] delta delta Ct (ddCt) 값과 Fold Change 자동계산하기

 

[과학체험] 현미경 체험 캠프

 

안녕하세요? NV2NGN입니다.

 

이 계산은 Window에 최적화 되어 있으며 컴퓨터 환경에 따라 시간이 조금 걸릴 수 있습니다.

 

 

화면에 뜨는 Blank box에 아래와 같이 순서대로 입력하세요.

아래 Ct 값은 최소 3번 반복하여 평균 값을 사용하기를 권장합니다.

 

1. Enter the average Ct value of the internal control gene of the control group (대조군의 internal control 유전자(예, GAPDH, beta actin 등) 의 평균 Ct 값 입력한다)
2. Enter the average Ct value of the target gene of the control group (두번째로 대조군 타겟 유전자(예, TP53)의 평균 Ct 값 입력한다)
3. Enter the average Ct value of the internal control gene of the test group (세번째로 테스트군 internal control 유전자의 (예, GAPDH, beta actin 등) 평균 Ct 값 입력한다)
4. Enter the average Ct value of the target gene of the test group (네번째로 테스트군의 타겟 유전자(예, TP53)의 평균 Ct 값 입력한다)

그러면 하단 검은 화면을 배경으로 delta delta Ct 값과 Fold change 값이 자동으로 계산 되어 나옵니다.

하단 검은 화면을 복사/붙여 넣기 하시면  값을 확인하기 쉽습니다.

새로 고침하면 다시 작동합니다.

 

 

 

관련 링크는 아래와 같습니다.

 

 

Real-time PCR Ct 값으로 fold change 구하기 3단계 - metabiocinelab

 

지금까지 NV2NGN이었습니다.

 

감사합니다.

 

Xi = float(input('Enter the average Ct value of the internal control gene of the control group: ')) Xt = float(input('Enter the average Ct value of the target gene of the control group: ')) Yi = float(input('Enter the average Ct value of the internal control gene of the test group: ')) Yt = float(input('Enter the average Ct value of the target gene of the test group: ')) delta_Ct_X = Xt - Xi delta_Ct_Y = Yt - Yi delta_delta_Ct = delta_Ct_Y - delta_Ct_X fold_change = 2 ** (-delta_delta_Ct) print(f'Delta delta Ct: {delta_delta_Ct}') print(f'Fold change: {fold_change}')

 

 

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