[궁금사전] 유전자 세트 농축 분석 (Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)

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Gene Set Enrichment Analysis (GSEA)은 생물정보학에서 사용되는 계산 방법으로, 

특정 유전자 집합이 두 생물 조건 또는 형질 간에 통계적으로 유의한 차이를 보이는지 여부를 확인하는 데 사용된다.

GSEA에서는 먼저, 알려진 경로, 유전자 온톨로지 (GO) 범주 

또는 문헌 기반 주석과 같은 생물학적 지식에 따라 유전자가 집합으로 그룹화된다. 

 

 

 

그런 다음, 주어진 샘플의 모든 유전자의 발현 수준을 통계적 방법을 사용하여 기준 집합과 비교한다. 

 

이 비교를 통해 특정 유전자 집합에 속한 유전자가 특정 생물학적 조건에서 유의하게 풍부하거나

감소하는지 여부를 확인할 수 있다.

GSEA는 공동 규제 유전자나 특정 생물학적 과정에서 중요할 수 있는 전체 경로를 식별하는 등

전통적인 유전자 수준 분석보다 여러 가지 장점이 있다.

 

이 방법은 대규모 데이터 세트를 분석하고 특정 표현형 또는 질병과 관련된 기저 생물학적 메커니즘을 이해하기 위해,

전사체학, 단백질체학 및 유전체학 연구를 포함하여 유전자 발현 연구에서 널리 사용된다.

 

 

 

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