[궁금사전] Metagenomics binning이란?

가끔 바이오인포매틱스(bioinformatics) 관련 논문에서 binning이란 단어를 만난다. 사전적 용어로 'bin'을 찾아 보면, 쓰레기통, (흔히 뚜껑이 달린 저장용) 통을 말하는데, 통 감이 잡히질 않는데, 위키피디아에 따르면, 차세대시퀀싱 데이터를 다루는 생물정보학에서의 binning이란 특히 metagenomics에서의 의미는 읽기 reads 또는 콘티그 contigs를 그룹으로 묶고 개별적인 게놈 (genome)에 할당해 나가는 과정을 말한다. 예를 들어 보자. 아래 논문 초록을 보면, binnig의 의미와 함께 contigs가 나온다. 메타게놈 시퀀싱의 비약적인 발전으로 다양한 환경에서 직접 미생물 군집을 연구할 수 있다. Metagenomics binning은 미생물 군집의 종 특성화..

2023.08.23