[궁금사용설명서] 갤럭시로 bam to fastq 전환하기

오늘은 사전적 의미인 은하수, 은하계의 뜻을 가진 웹 사이트 갤럭시(Galaxy)에서 bam 파일을 fastq 파일로 전환하는 간단한 단계를 살펴보고자 한다. Galaxy는 데이터 집약적인 생물 의학 연구에 사용할 수 있는 오픈 소스 웹 기반 플랫폼으로 알려져 있다. 1. bam 파일이 뭔가? 사전적 의미로 bam은 멍청이 등등으로 불리지만, 일루미나 사에서 설명하는 bam 파일의 정의는 아래와 같다. BAM 파일(*.bam)은 최대 128Mb의 정렬된 시퀀스를 나타내는 데 사용되는 SAM 파일의 압축된 바이너리 버전으로 알려져 있다. BAM 파일은 시료명_S#.bam의 파일 명명 형식을 사용한다. 여기서 #은 실행을 위해 샘플이 나열되는 순서에 따라 결정되는 샘플 번호다. 다중 노드 모드에서는 샘플 순..

2023.08.23