[궁금사전] 샤논 지수 (Shannon Index)와 알파 다양성 (alpha diversity)의 척도

[과학체험] 현미경 체험 캠프 현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링 nv2ngn.tistory.com 오늘은 마이크로바이옴과 관련한 샤논 지수에 대해 알아 보자 # 샤논 지수가 뭐야? 샤논 지수(Shannon index)는 군집 내에서 종의 다양성을 정량화하는 데 사용되는 알파 다양성의 척도이다. 마이크로바이옴 연구에서 Shannon 지수는 종종 샘플에 존재하는 미생물의 다양성을 평가하는 데 사용된다. 샤논 지수를 계산하기 위해 샘플에 있는 각 종의 상대적 풍부도를 결정한 다음 다음 공식을 사용하여 지수를 계산한다. H = -Σ(p_i * ln(p_i)) 여기..

2023.04.13