미생물(3)
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[궁금사전] 운전자 승객 가설(Drivers and Passengers Hypothesis)과 리벳 가설 (Rivet Hypothesis)
# 운전자 승객 가설(Drivers and Passengers Hypothesis)과 리벳 가설 (Rivet Hypothesis)의 차이 마이크로바이옴 세계에서 "운전자와 승객"가설 대 "리벳" 가설 최근 우리 몸에 서식하는 인간 마이크로바이옴은 아주 매력적인 연구 분야로 떠올랐다. 이 미생물은 인체에서 다양한 생리/생화학적 과정에 영향을 주면서 인간의 건강을 유지하는 데 중요한 역할을 하며 균형이 깨질 경우 질병에도 영향을 준다. 인체 마이크로바이옴 세계에서 두 가지 유명한 이론, "운전자 및 승객" 가설과 "리벳"가설은 다른 관점에서 이해하고 있다. # 운전자 승객 가설(Drivers and Passengers Hypothesis) 이 가설은 "운전자"라고 하는 특정 미생물 분류군이 인체 건강에 상당..
2023.06.13 -
[궁금사전] 샤논 지수 (Shannon Index)와 알파 다양성 (alpha diversity)의 척도
[과학체험] 현미경 체험 캠프 현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링 nv2ngn.tistory.com 오늘은 마이크로바이옴과 관련한 샤논 지수에 대해 알아 보자 # 샤논 지수가 뭐야? 샤논 지수(Shannon index)는 군집 내에서 종의 다양성을 정량화하는 데 사용되는 알파 다양성의 척도이다. 마이크로바이옴 연구에서 Shannon 지수는 종종 샘플에 존재하는 미생물의 다양성을 평가하는 데 사용된다. 샤논 지수를 계산하기 위해 샘플에 있는 각 종의 상대적 풍부도를 결정한 다음 다음 공식을 사용하여 지수를 계산한다. H = -Σ(p_i * ln(p_i)) 여기..
2023.04.13 -
[궁금사전] 알파 다양성(Alpha Diversity)과 베타 다양성(Beta Diversity) 그리고 감마 다양성(Gamma Diversity)
[과학체험] 현미경 체험 캠프 현미경 체험 캠프에 대해 공유하고자 한다. 이 캠프에서는 중고등학생을 대상으로 현미경의 작동 원리와 사용법을 배우고, 다양한 시료를 관찰하고 생각하는 시간을 갖게 된다 참가 신청서 링 nv2ngn.tistory.com 알파, 베타 및 감마 다양성은 특정 생태계에서 미생물 다양성의 다른 측면을 설명하는 용어다. 마이크로바이옴은 인간의 위장관이나 토양과 같은 특정 환경에 서식하는 미생물의 집합체다. 다음은 각 다양성 측정 방법이 마이크로바이옴과 어떻게 관련되는지에 대한 설명이다. # 알파 다양성 (Alpha Diversity) 알파 다양성은 미생물 군집 내에서의 다양성을 나타내는 개념이다. 즉, 미생물 군집 내에 다양한 종이 존재하고, 분포가 균등하게 되어 있으면, 알파 다양성..
2023.03.23